判断PCR污染是否彻底清除,可以采用以下几种方法:
1.环境表面采样检测
使用无菌拭子蘸取灭菌水,对实验台面、移液器、PCR仪等关键区域表面进行涂抹采样。
提取样本核酸后,通过实时荧光PCR检测目标片段,若结果为阴性(无扩增曲线或Ct值>35),提示表面污染已清除。
2.连续3天阴性对照无扩增
每日实验需设置阴性对照(如无模板水或缓冲液),若连续3天阴性对照均无扩增(CT值>35或无非特异性曲线),表明无残留扩增产物污染。
阴性对照应随机置于临床样本中,覆盖提取、扩增全过程,避免假阴性。
3.空白样本检测阴性
空白样本(如无菌水)需与测试样本同步处理,若检测结果为阴性,可排除试剂、耗材或环境中的核酸污染。
建议每批次样本至少设置1个空白对照,高频次检测可提高可靠性。
结论与注意事项
核心指标:环境采样阴性 + 阴性对照无扩增 + 重复实验稳定,三者同时满足即可判定污染彻底清除。
常见误区:仅依赖紫外照射或酒精擦拭可能无法彻底降解短片段核酸,需配合专用清除剂。
通过上述方法,可以综合评估PCR实验室的核酸污染是否已经被彻底清除。