说实话,刚用上通用型PCR试剂盒那会儿,我内心是抗拒的。
老是感觉“通用”这俩字, 听起来就好似“凑合”、“差不多”、“不出彩”。进行实验, 哪个人不想去使用那个专门针对自身实验设计打造出来的、带有名字的试剂盒? 就如同定制西装那般, 骄傲极了。
但后来被课题组预算狠狠教育了一顿。
什么叫“通用”?
不是“啥都能凑合”的意思。
一款通用型PCR试剂盒的底层隐含逻辑实际上是相当残酷的, 它必须要兼容各种各样的模板, 还要兼容各种各样的引物, 同时也要兼容各种各样的GC含量, 以及各种各样的离子浓度。为了能够达成做到这一点的目标, 它需要牺牲掉一点极致灵敏的特性, 从而换回一种进入“稳定到十分无聊的状况”的状态。
无聊,恰恰是最珍贵的。
你去思考一下, 实验室最为惧怕的是什么呢? 并非是跑不出来条带, 而是你在今天能够跑出来, 然而到了明天却跑不出来了。使用的是同一个模板, 运用的是同一个引物, 遵循的是同一个程序, 可是结果却如同跟你耍小孩脾气一般。通用型试剂盒最为关键的价值所在, 便是要把这种“耍小孩脾气”的概率降低到最小程度。
它真的什么都能扩吗?
别信广告。
使用过多个品牌通用型试剂盒的我, 老实讲, 它绝非万能胶。碰到GC含量高的情况,遇到有复杂二级结构的状况, 或者面对模板里杂质特别多的情形, 它偶尔也会“翻白眼”。
但它的优势在于“下限高”。
什么意思呢?
那么就是你无需煞费苦心去调整buffer, 无需添加DMSO, 无需更换酶, 直接投进去运行便可以了。即便运行出来的结果再糟糕, 起码会有条带。对于刚刚开始从事PCR的师弟师妹而言, 这属于救命级别的善意。
为什么实验室老人都备着这个?
我观察过。
那些从事PCR工作长达十年之久的人, 在其手边很大概率会放置一盒通用型PCR试剂盒。并非由于他们无法构建良好的体系, 恰恰相反, 是因为他们对相关知识掌握得极为透彻——他们明白众多实验无需过度折腾, 他们知晓一次成功相较于追求极致灵敏而言重要程度高出一万倍。
“稳”就一个字。
并且, 通用型PCR试剂盒如今迭代迅速, 有些品牌增添了热启动机制, 有些优化了缓冲液的pH缓冲能力,有些甚至能够承受一定的杂质干扰, 哪怕你今日使用的是粗提的基因组, 也都能为你扩增出来。
踩过的坑说几句
别图便宜。
有一些廉价到超乎想象的通用型试剂盒, 其扩增效率存在问题, 保真度存在问题, 稳定性也存在问题。节省下来的那些钱, 最终全都耗费在重复进行的实验以及白白浪费的时间上面了。
而且, 不要老是置于冰箱之中。在使用之际将其取出, 要是没有用完就尽快放回去。由于酶这种物质, 极其惧怕反复经历冷冻与融化的过程。不要询问我是如何知晓的, 曾有两次我把整盒的都冻坏了, 心疼得内心犹如滴血一般。
最后说句大实话
并非实验室的“主角”是通用型PCR试剂盒, 它更像是一颗沉默的螺丝钉。
它不会致使你所发文章的要点瞬间火爆, 不会使得你的数据美妙到令审稿人惊艳。然而它同样不存在处于你最为急需得出结果之际, 给你造成失误的这种情况。
有时候,科研需要的不是英雄,而是一个不找你麻烦的工具。
真的。
能够借助通用型去达成的事项, 任其实现算了, 将精力以及预算投放至更具折腾价值的所在之处。
这不叫将就,这叫清醒。