预防PCR产物污染的关键在于从源头控制和操作过程中的严格管理。以下是一些有效的预防措施:
一、实验室分区管理
严格划分样本处理区、反应体系配制区和扩增产物分析区,各区需物理隔离并配备独立移液器。
扩增产物分析区应远离样本处理区,避免气溶胶扩散。
二、操作规范
使用带滤芯枪头,每加一个样本更换枪头,移液器外壁用75%酒精擦拭。
预混试剂时先配制主反应液,最后加入模板DNA,减少开盖次数。
离心管开盖前短暂离心,防止液体溅出。
三、试剂与设备处理
分装试剂并标记批号,避免反复冻融导致浓度不均。
移液器、离心机等设备定期用稀酸(1mol/L HCl)或紫外灯(254nm,30分钟)处理。
四、污染清除技术
使用dUTP-UNG酶系统:在PCR反应液中掺入dUTP,扩增后通过尿嘧啶糖基化酶(UNG)降解含dU的产物,防止残留污染。
稀酸处理法:1mol/L HCl擦拭污染表面,使DNA脱嘌呤失活。
五、环境监控与日常维护
定期对实验室环境进行监测,包括空气、物体表面的核酸检测,以确保没有污染。使用含UNG酶的荧光PCR检测试剂盒可以降低污染风险。
六、应急处理
一旦发现污染,立即采取措施,如更换污染区的耗材,使用核酸清除剂处理污染区域,以及加强实验室的通风和紫外线照射消毒。
七、日常清洁
实验前后用70%乙醇或有效氯消毒液对工作台、移液器等进行消毒,避免核酸酶和细菌污染。
八、避免开盖操作
尽可能实现闭管操作,减少样品和产物的暴露,特别是在加样和开盖时。
通过这些措施,可以有效降低PCR产物污染的风险,确保实验结果的准确性和可靠性。