PCR检测法是一种广泛用于检测细胞培养中支原体污染的方法,其具体步骤如下:
一、实验准备
准备培养48小时以上的细胞培养上清液、预混反应液(Mix)、阴性对照(无酶水)和阳性对照(支原体DNA)。
在生物安全柜中操作,对桌面和手部进行消毒。
二、操作步骤
1、样品收集
收集待测细胞的培养上清液,可直接使用或先进行细胞裂解以释放DNA。
2、DNA模板制备
对于细胞上清液,直接取适量用于PCR。
对于细胞悬液,需先进行DNA提取。常用方法包括酚/氯仿抽提、乙醇沉淀或其他DNA纯化试剂盒。
3、PCR反应体系配置
根据PCR试剂盒说明书,准备反应混合液,通常包括引物、dNTPs、缓冲液、Taq DNA聚合酶、模板DNA等。
反应体系中可能还需加入阳性对照、阴性对照和内对照。
4、PCR扩增
将反应混合液加入PCR管中,盖紧盖子,防止污染。
在PCR仪上设置扩增程序,通常包括变性、退火和延伸三个阶段,循环多次。
反应结束后,进行琼脂糖凝胶电泳,以观察扩增产物。
5、结果分析
通过凝胶成像系统观察电泳结果,寻找特定大小的DNA条带。
阳性结果通常表现为在特定位置出现明亮的条带,与阳性对照条带位置一致。
有时需要通过比较Ct值进行定量分析。
三、关键注意事项:
1、防污染措施:
实验分区操作(样本处理、PCR配制、扩增区分开);
使用带滤芯枪头,操作台紫外消毒30分钟。
2、对照设置:
阳性对照:已知支原体DNA;
阴性对照:无菌水代替模板;
内参对照:确保DNA提取有效(如宿主基因)。
3、假阳性处理:
若条带微弱,建议结合荧光染色法或qPCR复检。
通过上述步骤,PCR检测法能够快速、准确地检测细胞培养中的支原体污染,是实验室中常用的检测手段之一。