进行分子生物学实验时,能帮忙提升效率的重要工具是快速PCR扩增试剂盒。和传统PCR作比较,它凭借优化酶体系以及缓冲液成分,可以把扩增所需要长达两至三小时的时间,缩短为仅需三十至六十分钟。对于该技术,如果想要更好地加以利用,那么就需要理解其设计原理,以及所适配的场景。
快速PCR原理是什么
快速PCR的关键之处在于运用了改造后的DNA聚合酶,该酶具备更高的延伸速度以及热稳定性。与此同时,试剂盒里的缓冲液能够更高效地调控离子强度,促使引物与模板的结合得以加速。除此之外,快速循环程序缩短了变性、退火和延伸步骤的保温时间,但是始终确保扩增的特异性。
如何选择快速PCR扩增试剂盒
选择之际,需考量三个要素,其一为扩增片段长度,其二是模板复杂度,其三乃检测灵敏度,对于三百碱基对以下的短的片段,多数试剂盒皆可胜任,然而长片段或者高GC含量的模板,就需要去挑选专门经优化的产品,查看说明书当中的扩增曲线以及熔解曲线数据,能够判断其特异性的表现,优先去选择经过多物种验证的试剂盒,以此减少优化成本。
使用快速PCR试剂盒注意事项
模板质量会正对扩增成功率产生直接影响,快速PCR对于抑制剂更为敏感,所提取的DNA要保证不存在蛋白或者酚残留,退火温度的设定建议借助梯度PCR预先加以确定,相比理论值略微高出2至3℃能够减少非特异性条带,循环数不适合超过35个,不然容易出现拖尾或者弥散现象,每次实验都要设置阳性对照以及阴性对照,以此便于能够快速排查问题。
快速PCR与普通PCR区别
主要差异存在于时间效率以及酶活性方面。普通PCR运用Taq酶,其延伸速度大概是1kb/min;快速PCR采用突变型聚合酶,速度能够达到2 - 4kb/min ,并且不需要热启动步骤。快速试剂盒的循环程序总体时长一般处于45分钟以内,然而普通程序则需要2小时以上。不过,针对极低拷贝数或者具有复杂二级结构的模板,普通PCR的稳定性或许会更优良。