聚合酶链式反应也就是PCR其所运用的试剂盒属于分子生物学实验室的基础性工具,该试剂盒的性能能够直接地决定实验数据的可靠性。在市场当中存在着众多的品牌以及型号,要怎样去选择一款跟自身实验体系相适合的试剂盒呢,就需要从灵敏度、特异性、扩增效率等这些核心指标方面着手,并且还要结合具体的应用场景来进行综合判断。
如何判断试剂盒灵敏度
灵敏度所指为试剂盒能够检测到的最低模板量,在实际评估之际,建议针对目标模板开展10倍梯度稀释,进而观察不同稀释度情形下的扩增曲线起峰状况,灵敏度较高的试剂盒于模板浓度极低之时依旧能够给出典型S型曲线,并且Ct值重复性良好,在操作过程当中需要设置无模板阴性对照,要是阴性对照出现扩增,这提示有可能存在引物二聚体或者污染,如此会干扰灵敏度的判断。
怎样评估扩增效率
每个循环里模板倍增的实际倍数体现了扩增效率,理想效率应当处于90%至110%之间,构建标准曲线之际,把已知浓度的模板开展至少5个梯度的10倍稀释,用log模板量当作横轴,将Ct值作为纵轴,借助斜率来计算效率,效率等于(10^(-1/斜率)-1)×100%,要是斜率接近-3.32,效率就接近100%,效率偏低或许暗示试剂里酶活性不足或者存在抑制剂残留。
储存条件影响有多大
PCR试剂盒一般含有聚合酶、dNTPs、缓冲液等成分,聚合酶对温度敏感,长期储存建议放在-20℃稳定环境,防止反复冻融,因为每次冻融可能让酶活性降低5%-10%,短期使用时可暂存于4℃(不超过一周),运输过程要使用干冰或生物冰袋,收货后马上检查冰袋状态,要是发现试剂融化或包装破损,应重新评估性能后再使用。
如何匹配具体实验类型
不同的实验,对于试剂盒的要求差异显著,普通的定性PCR看重快速扩增,能够选用含有耐热DNA聚合酶的基础型试剂盒作选择,荧光定量PCR也就是qPCR须得试剂中预先混合荧光染料或者探针,并且对于扩增均一性的要求更为高些,多重PCR则要着重留意引物之间的交叉干扰,得选择经过优化配方的专用试剂盒才行,依据样本类型比如血液、组织、土壤等去挑选带有相应抑制物耐受性的产品,能够减少纯化步骤所带来的误差。
没有绝对标准去选择PCR试剂盒,关键在于性能参数是不是契合您的实验体系,您在实际使用当中最看重哪一个指标,欢迎在评论区交流您的经验。